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La Etapa Nacional en la Zona Sur de la Copa Perú 2025 cerró los cruces de 16avos de final con los partidos de vuelta disputados en diversas sedes del sur peruano. Los resultados determinaron los equipos clasificados a los octavos de final, mientras que un encuentro fue suspendido por agresión al arbitro y queda pendiente de resolución.
Los clubes que lograron avanzar lo hicieron por marcador global, consolidando su presencia en la siguiente fase del torneo:
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Clasificados a octavos de final – Zona Sur
- Viargoca FC (Arequipa 1)
- Deportivo Huancarama (Apurímac 2)
- Amigos de la PNP (Arequipa 2)
- Calidad Porteña (Callao 1)
- Unión Social de Pacopata (Cusco 2)
- Señor de Quinuapata FC (Ayacucho 2)
- San Martín de Chupa (Puno 2)
- Atlético Chanchamayo (Junín 2)
- Diablos Rojos (Huancavelica 2)
- Sport Machete (Huancavelica 1)
- Hacienda San Agustín (Callao 2)
- Defensor Patibamba (Ayacucho 1)
- Juventud Huracán (Lima 3)
- Alianza Pisco (Ica 1)
- CD Barrio 12 (Moquegua 2
Partido suspendido
• CD ANBA Perú (Puno 1) vs Atlético Sumar Motors (Junín 3) – Suspendido
Copa Perú Etapa Nacional 2025: Resultados de los partidos de vuelta de los 16avos de final zona sur, clasificados: